Para cumprir as exigências da Carta Régia do rei Dom João VI, que determinava uma comunicação por terra entre Rio de Janeiro e Bahia livre de ataques indígenas, foi desencadeada uma verdadeira guerra contra os Borun, também conhecidos como Botocudo.

A estratégia adotada foi a ocupação da região por destacamento militares. Entre 1800 e 1814 foram construídos sete quartéis no sul da Bahia, 27 no nordeste e leste de Minas (sendo vinte na região do rio Doce) e 38 no Espírito Santo.

A maioria destes quartéis consistia em casas de taipa, cobertas de palha e protegidas por cercas de pau-a-pique. Ao redor havia plantações de milho e mandioca que não só alimentavam os soldados, mas também atraíam populações indígenas menos agressivas, com dificuldades em subsistir devido às pressões da sociedade envolvente.

Muitos destes indígenas tornaram-se mão-de-obra nas vilas das regiões e também foram empregados como guias nos ataques contra os Botocudo, como o famoso Pocrane, que se tornou nome de uma cidade de Minas Gerais.

Família de Botocudo (Guerén). Gravura em cobre de Maximilian von Wied-
Neuwied, que esteve no Brasil entre 1815 e 1817 e viajou pelo Rio de Janeiro,
Espírito Santo, Minas Gerais, fazendo levantamentos da flora e da fauna, tendo
entrado em contato com os Puri, Botocudo e Kamakã, dos quais fez registros
iconográficos.